至于白醋是否真的可以清洗太阳能热水器，这个问题也有讨论。水垢较多的地方，集热管里面也会进入水垢，包括出水管也会有。如果水垢情况严重，最有效的办法是把集热管一个个拆开（要特别小心），然后清理水箱内部的水垢，再清洗集热管。如果水垢不严重，有人设想用细线绳串成一串山楂，从加热棒端口放进去清洗，这个方法在电水壶上效果很好，但在太阳能热水器上还没有试行过。
太阳能如何清洗？清洗后渗水怎么办？
如果是硅胶圈损坏导致的漏水，处理方法会有所不同。因为硅胶圈位于内部，所以首先需要把真空管拆下来，然后用手触摸水箱内的硅胶圈，检查它是否脱落。如果脱落了，就把它拿出来；如果没脱落，也要取下来。取下硅胶圈后，把周围的保温材料清理干净，最后再把硅胶圈安装回去，然后重新安装拆下的真空管。
关于清洗太阳能水垢用什么比较好，有些建议可以考虑。太阳能热水器到花洒之间的水头高度大约2米，扣除管路沿程损失和局部损失后，剩下的出流水头其实并不大。如果太阳能热水器使用时间久了，水垢积累较多，管路里的水垢会造成更大的水头损失。所以建议可以清理管路，然后在热水管路这边加装一个加压泵来改善水流。
水箱内部的清理最好能拆下水箱，放在平地上进行。可以用平滑的钩子或其他长柄工具伸进去，把里面的水垢弄出来。也可以轻轻敲击水箱帮助水垢松动，但千万不能用力过猛，以免损坏水箱。同时要检查密封圈是否老化，在清理周围污垢时用手触摸密封圈，如果感觉发硬，就说明已经老化失去弹性，需要更换新的。
对于那些结垢比较严重、已经明显影响热效率的太阳能热水器，就必须采用拆解清洗了。因为太阳能水箱里的水温比较高，经常接近沸腾，所以水垢会积累得特别多。尤其是农村地区直接使用井水的，结垢情况会更加严重。储水箱里的水垢影响相对小一些，但真空管里的结垢会直接影响升温效率，严重时甚至可能导致夏季爆管或者冬季开裂，所以定期拆解清洗很有必要。
拆解清洗虽然没有太高的技术难度，但操作时一定要细致小心。开始之前需要准备好易损的零配件和专用的工具，以防在拆卸过程中损坏需要更换。首先要处理除尘，准备好浓洗洁剂液作为润滑，脱下防尘圈，用大号注射器把润滑液注入防尘圈的缝隙里。同时可以用细竹签或铁丝小心地挖出堆积的尘垢，然后再注入一些润滑液帮助松动。
太阳能清洗后如果出现渗水，首先要观察确定具体是哪个部位漏水，然后根据漏水位置采取相应的维修措施。如果是真空管漏水，需要先关上水龙头。如果是自动上水的系统，要先关闭电源，再把水箱里的水排出来，然后把损坏的真空管取下来。如果真空管取不下来，可以涂抹一些润滑剂，然后倾斜水箱把真空管拔出，再去商店买新的真空管安装上即可。
真空管依次拆下后，要同时倒出里面的水垢进行初步清理。拆下来的管子要放在阴凉处遮荫，或者在没有水的情况下放在阳光下曝晒。遮荫主要是为了防止管子温度过高，等下注入清洗液时因为温差太大而导致炸裂。可以用塑料管缠上棉絮，沾上清洗液，轻轻用力转动来刷洗管内壁的水垢；也可以用高压水枪或水泵进行冲洗。检查清洗效果时，可以对着阳光看，管内壁呈现红亮色泽就是洗干净了，如果还有水垢粘附，很容易就能看出来。
如果出现意外情况，比如真空管损坏了，一时又买不到新的，可以用堵头封孔，或者把坏管的尾部插入水箱暂时堵住水流，以后再更换新管。另外，排污口一般是用47毫米堵头密封的，拆解也比较麻烦。可以考虑改装成大流量出口，既能出水也能排污，一两用。
安装完成后要进行检查。如果是带水安装的，可以先上少量水，查看真空管孔处是否漏水。如果是空管安装，可以等到晚上上水，第二天再检查。一是检查是否漏水，这个容易发现。二是检查是否漏气，漏气的管子不容易发现。等到晴天中午水温升高时，用手触摸真空管外壁，如果发凉说明是好管，如果发热发烫就说明管子坏了，需要更换。
安装好密封圈后，把水箱放回原来的位置。接下来是回装清洗好的真空管。虽然拆下来难，但装回去相对容易。要在管口外壁涂抹润滑液。有两种方法：一种是管内注满水，带水安装，装好后就可以立即上水，适合安装后马上试验是否漏水。另一种是空管回装，装好后等到晚上或第二天早上再上水，因为空管在高温下突然上冷水容易炸裂。
具体操作时，先套入防尘圈，涂抹润滑液，双手握住真空管，对准密封孔，轻轻插入圆孔，注意不要用力过大。旋转插入时稍有阻力是正常的，如果突然感觉无力，就要检查一下，左右摇一下如果有晃动，说明可能把密封圈顶脱或顶入水箱内了，需要拔出来重新安装。最好两个人协作，一个人主操作拿管向水箱内旋转装入，另一个人递管并护住管尾防止碰伤。先装入管子，再回拉放入托碗就可以了。全部完工后，推入防尘圈。
如果太阳能热水器购置时间不长，水源水质也比较好的话，水箱结垢程度可能比较轻。这种情况下可以考虑用酸类溶液进行不拆解的简易清洗。比如可以购买专用的清洗剂，或者用食醋自己配制溶液，然后注入水箱。让溶液在一两个晴天里随着水温升高产生微循环，之后再注入清水，打开排污口把污水放掉，反复上水放水几次就行。这种方法方便快速，但清洗可能不够彻底，而且酸性溶液有可能腐蚀水箱和金属接头，需要注意使用频率和浓度。
接下来是拆卸真空管，这是整个拆解过程中最大的难关。要一边转动真空管，一边同时向上用力，边转边用力向水箱内部插入。最好使用专用夹具，这样既安全又能防止伤手。当真空管离开底托后，再转动着向下把它抽出来。操作时一定要特别注意，防止碰伤管尾的抽气嘴，这个部位很脆弱。
重新安装时，如果需要更换密封圈，在地面上操作会更方便。一般拆解后都建议更换，每个密封圈价格很便宜，大概五毛钱左右。可能需要用到专用长柄钳，价格也不贵。安装时用钳子把密封圈夹成C形，让中间的凹槽对准水箱的拔口位置。这是防止安装后漏水的关键步骤，必须仔细检查确保密封严实。更换密封圈有些麻烦，如果孔周围的发泡层影响安装，可以用小刀稍微削大一点。密封圈有内外之分，外圈直径稍小的那面朝水箱内，内径像八字口、外径稍大的朝水箱外，如果装反了，容易顶入水箱内部，密封性能会变差甚至导致漏水。