从实际应用角度来看，虽然臭氧消毒杀菌的效果非常可靠，但其运营成本较高。维护工作量较大，管理难度也比较大，而且操作相对复杂。因此在选择消毒方式时，需要综合考虑这些因素。
臭氧是如何实现杀菌消毒的
臭氧杀菌的核心在于其强氧化性，它能迅速破坏微生物的细胞膜结构。具体来说，臭氧会与细菌细胞壁中的脂类双键发生反应，穿透菌体内部，攻击蛋白质和脂多糖，从而改变细胞的通透性，导致细菌死亡。
对于病毒，臭氧主要通过氧化作用直接破坏其核糖核酸RNA或脱氧核糖核酸DNA。臭氧首先攻击病毒衣壳蛋白的多肽链，导致RNA受损，特别是破坏构成衣壳的蛋白质。电镜观察发现，噬菌体被臭氧水解后，表皮碎裂成碎片并释放核糖核酸。
除了破坏细胞壁，臭氧还能作用于细胞内的核物质，比如毁坏DNA中的嘌呤和嘧啶。它首先损伤细胞膜成分造成代谢障碍，随后渗入内部破坏脂蛋白和脂多糖，进一步改变通透性，最终导致细胞沉淀和死亡。
需要纠正一个常见的误解：毒是化学物质，而菌是生物体。臭氧的主要功能是杀菌，即杀死细菌等微生物，而不是传统意义上的消毒化学剂。虽然口语中常混用，但在科学定义上，臭氧的作用对象是活的微生物。