由于上述残留微生物的存在，巴氏消毒后的牛奶保质期相对较短，通常只能保存3到10天，极端情况下最多也就16天。这意味着消费者购买后需要尽快饮用，不能长时间常温存放，这是其主要的局限性之一。
巴氏消毒法有哪些优缺点？
法国人巴斯德在1865年发明了牛奶巴氏消毒法，这个技术经过后人不断的改进和完善，现在被广泛用于杀灭啤酒、酒类、牛奶以及血清白蛋白等各种液体中的病原体，可以说它是全球通用的牛奶消毒标准方法。
使用巴氏消毒法处理的纯鲜奶，能够非常很好地保留牛奶原有的营养成分和天然风味。在所有不同种类的牛奶产品中，经过这种工艺处理的纯鲜奶被认为品质最好，是消费者值得选择的一种健康饮品。
不过需要注意的是，巴氏消毒法并不能杀灭所有的微生物，它处理后仍会残留少部分无害或有益、且比较耐热的细菌或细菌芽孢。因此，这种牛奶必须在4摄氏度左右的低温环境下进行保存，以确保食品安全。